Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
GferP56213 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
GferP56213 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms