Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fgd1P52734 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms