Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
TspoP50637 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
TspoP50637 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TspoP50637 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms