Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PtpreP49446 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PtpreP49446 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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