Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VdrP48281 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VdrP48281 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VdrP48281 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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