Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf9P41274 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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