Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ThpoP40226 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ThpoP40226 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms