Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PpargP37238 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PpargP37238 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PpargP37238 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpargP37238 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpargP37238 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PpargP37238 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PpargP37238 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms