Protein–RNA interactions for Protein: P31361

Pou3f3, POU domain, class 3, transcription factor 3, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f3P31361 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pou3f3P31361 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pou3f3P31361 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms