Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PtprmP28828 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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