Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
RxraP28700 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RxraP28700 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
RxraP28700 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RxraP28700 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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