Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Cd40lgP27548 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms