Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChgaP26339 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChgaP26339 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms