Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RarbP22605 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
RarbP22605 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RarbP22605 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RarbP22605 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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