Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
Vpreb2P13373 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms