Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P10404 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P10404 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P10404 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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