Protein–RNA interactions for Protein: P0CW03

Ly6c2, Lymphocyte antigen 6C2, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c2P0CW03 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm5471-201ENSMUST00000072732 337 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 mt-Nd1-201ENSMUST00000082392 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ly6c2P0CW03 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms