Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P01649 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P01649 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms