Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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BckdkO55028 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
BckdkO55028 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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