Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
EdaO54693 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
EdaO54693 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms