Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Cited2O35740 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Cited2O35740 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms