Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ciart-201ENSMUST00000036418 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Mbtd1-204ENSMUST00000107852 1930 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Klra3-202ENSMUST00000111998 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm26765-201ENSMUST00000180844 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm36862-204ENSMUST00000223365 642 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Zfp850-201ENSMUST00000099111 941 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Lhx8O35652 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Lhx8O35652 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms