Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Prrt1O35449 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Prrt1O35449 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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