Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dgcr6O35347 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms