Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cnih2O35089 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Cnih2O35089 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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