Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Casq1O09165 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Casq1O09165 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Casq1O09165 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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