Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
EllO08856 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
EllO08856 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
EllO08856 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
EllO08856 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
EllO08856 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
EllO08856 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms