Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim18J3QNP2 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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