Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Ccdc180J3QNE4 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc180J3QNE4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc180J3QNE4 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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