Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms