Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cldn34c3J3QJW5 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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