Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm21818J3KMS6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm21818J3KMS6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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