Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
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