Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ScaperF8VQ70 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms