Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm28048F7BCN0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Gm28048F7BCN0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Gm28048F7BCN0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm28048F7BCN0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
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