Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccdc175E9PVB3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms