Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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