Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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BC048679D3YXE9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
BC048679D3YXE9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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