Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Phf3B2RQG2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Phf3B2RQG2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms