Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uhrf1bp1B2KF50 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Uhrf1bp1B2KF50 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms