Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Scn3aA2ASI5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms