Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Rtf1A2AQ19 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms