Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms