Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm45191-201ENSMUST00000205846 5439 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vamp5Q9Z2P8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms