Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Ubl3Q9Z2M6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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