Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Trip6Q9Z1Y4 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trip6Q9Z1Y4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms