Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1R4

D17h6s53e, Uncharacterized protein C6orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17h6s53eQ9Z1R4 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
D17h6s53eQ9Z1R4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
D17h6s53eQ9Z1R4 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms