Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nek4Q9Z1J2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nek4Q9Z1J2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms