Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Skp2Q9Z0Z3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Skp2Q9Z0Z3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms