Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhx9Q9WUH2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhx9Q9WUH2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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